MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 3

Total Repeats: 1080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008505	AGA	2	6	264	269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326548
2	NC_008505	TCTA	2	8	273	280	25 %	50 %	0 %	25 %	116326548
3	NC_008505	CAA	3	9	297	305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326548
4	NC_008505	TAA	2	6	331	336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326548
5	NC_008505	CAA	2	6	350	355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326548
6	NC_008505	AG	3	6	388	393	50 %	0 %	50 %	0 %	116326548
7	NC_008505	ATT	2	6	416	421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326548
8	NC_008505	ACT	2	6	425	430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326548
9	NC_008505	GA	3	6	452	457	50 %	0 %	50 %	0 %	116326548
10	NC_008505	CTGG	2	8	494	501	0 %	25 %	50 %	25 %	116326548
11	NC_008505	CAA	2	6	534	539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326548
12	NC_008505	AGT	2	6	557	562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326548
13	NC_008505	ACATT	2	10	621	630	40 %	40 %	0 %	20 %	116326548
14	NC_008505	ATG	2	6	794	799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326548
15	NC_008505	GAT	2	6	857	862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326548
16	NC_008505	GAAA	2	8	906	913	75 %	0 %	25 %	0 %	116326548
17	NC_008505	AGG	2	6	937	942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326548
18	NC_008505	TTA	2	6	963	968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326548
19	NC_008505	TAA	2	6	979	984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326548
20	NC_008505	GAAA	2	8	1120	1127	75 %	0 %	25 %	0 %	116326548
21	NC_008505	AAAGT	2	10	1160	1169	60 %	20 %	20 %	0 %	116326548
22	NC_008505	CATT	2	8	1209	1216	25 %	50 %	0 %	25 %	116326548
23	NC_008505	CTGA	2	8	1280	1287	25 %	25 %	25 %	25 %	116326548
24	NC_008505	AAATGA	2	12	1311	1322	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116326548
25	NC_008505	GAT	2	6	1327	1332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326548
26	NC_008505	ATT	2	6	1466	1471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326548
27	NC_008505	CAA	2	6	1488	1493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326548
28	NC_008505	ACA	2	6	1499	1504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326548
29	NC_008505	TGA	2	6	1561	1566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326548
30	NC_008505	ATG	2	6	1619	1624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326548
31	NC_008505	TCT	2	6	1939	1944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326549
32	NC_008505	TTG	2	6	1966	1971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326549
33	NC_008505	AG	3	6	2022	2027	50 %	0 %	50 %	0 %	116326549
34	NC_008505	CTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326549
35	NC_008505	GTT	2	6	2072	2077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326549
36	NC_008505	AAG	2	6	2138	2143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326549
37	NC_008505	TAA	2	6	2163	2168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326549
38	NC_008505	TTAT	2	8	2242	2249	25 %	75 %	0 %	0 %	116326549
39	NC_008505	AAT	2	6	2283	2288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326549
40	NC_008505	ACTT	2	8	2295	2302	25 %	50 %	0 %	25 %	116326549
41	NC_008505	TGT	2	6	2391	2396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326549
42	NC_008505	AGA	2	6	2448	2453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326549
43	NC_008505	CTTT	2	8	2465	2472	0 %	75 %	0 %	25 %	116326549
44	NC_008505	AGA	2	6	2572	2577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326549
45	NC_008505	TTCTT	2	10	2603	2612	0 %	80 %	0 %	20 %	116326549
46	NC_008505	T	7	7	2816	2822	0 %	100 %	0 %	0 %	116326550
47	NC_008505	TTC	2	6	2834	2839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326550
48	NC_008505	T	6	6	2857	2862	0 %	100 %	0 %	0 %	116326550
49	NC_008505	TAT	2	6	2896	2901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326550
50	NC_008505	AGA	3	9	2948	2956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326550
51	NC_008505	TCG	2	6	3033	3038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326550
52	NC_008505	TTAC	2	8	3233	3240	25 %	50 %	0 %	25 %	116326551
53	NC_008505	AAAC	2	8	3256	3263	75 %	0 %	0 %	25 %	116326551
54	NC_008505	AGCA	2	8	3272	3279	50 %	0 %	25 %	25 %	116326551
55	NC_008505	AGA	2	6	3303	3308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326551
56	NC_008505	TGA	2	6	3330	3335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326551
57	NC_008505	GTT	2	6	3391	3396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326551
58	NC_008505	GGA	2	6	3451	3456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326551
59	NC_008505	AC	3	6	3511	3516	50 %	0 %	0 %	50 %	116326551
60	NC_008505	CAAG	2	8	3540	3547	50 %	0 %	25 %	25 %	116326551
61	NC_008505	ATTC	2	8	3551	3558	25 %	50 %	0 %	25 %	116326551
62	NC_008505	AAG	3	9	3589	3597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326551
63	NC_008505	ATGA	2	8	3643	3650	50 %	25 %	25 %	0 %	116326551
64	NC_008505	AC	3	6	3710	3715	50 %	0 %	0 %	50 %	116326551
65	NC_008505	GAA	2	6	3757	3762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326551
66	NC_008505	GAA	2	6	3766	3771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326551
67	NC_008505	CAA	2	6	3879	3884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326551
68	NC_008505	CAAAA	2	10	3887	3896	80 %	0 %	0 %	20 %	116326551
69	NC_008505	A	6	6	3893	3898	100 %	0 %	0 %	0 %	116326551
70	NC_008505	GAA	2	6	3913	3918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326551
71	NC_008505	AACAA	2	10	3955	3964	80 %	0 %	0 %	20 %	116326551
72	NC_008505	AAAC	2	8	4070	4077	75 %	0 %	0 %	25 %	116326551
73	NC_008505	AGA	2	6	4125	4130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326551
74	NC_008505	CAT	2	6	4133	4138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326551
75	NC_008505	CAAAAT	2	12	4185	4196	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116326551
76	NC_008505	ATG	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326551
77	NC_008505	GAA	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326551
78	NC_008505	ATG	2	6	4228	4233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326551
79	NC_008505	TTTA	2	8	4819	4826	25 %	75 %	0 %	0 %	116326552
80	NC_008505	CCG	2	6	5027	5032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116326552
81	NC_008505	ATT	2	6	5112	5117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326552
82	NC_008505	GTCA	2	8	5374	5381	25 %	25 %	25 %	25 %	116326552
83	NC_008505	GAA	2	6	5432	5437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326552
84	NC_008505	T	6	6	5507	5512	0 %	100 %	0 %	0 %	116326552
85	NC_008505	GAT	2	6	5576	5581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326552
86	NC_008505	AAT	2	6	5671	5676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326552
87	NC_008505	TGAAA	2	10	6025	6034	60 %	20 %	20 %	0 %	116326553
88	NC_008505	ATG	2	6	6180	6185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326553
89	NC_008505	AAG	2	6	6219	6224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326553
90	NC_008505	TAG	2	6	6232	6237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326553
91	NC_008505	TGT	2	6	6325	6330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326553
92	NC_008505	TCA	2	6	6508	6513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326553
93	NC_008505	AAAATT	2	12	6517	6528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326553
94	NC_008505	T	6	6	6592	6597	0 %	100 %	0 %	0 %	116326553
95	NC_008505	GTG	2	6	6602	6607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326553
96	NC_008505	TAA	2	6	6628	6633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326554
97	NC_008505	A	6	6	6632	6637	100 %	0 %	0 %	0 %	116326554
98	NC_008505	GAA	2	6	6681	6686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326554
99	NC_008505	T	7	7	6691	6697	0 %	100 %	0 %	0 %	116326554
100	NC_008505	TAG	2	6	6701	6706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326554
101	NC_008505	T	6	6	6786	6791	0 %	100 %	0 %	0 %	116326554
102	NC_008505	A	7	7	6799	6805	100 %	0 %	0 %	0 %	116326554
103	NC_008505	T	6	6	6815	6820	0 %	100 %	0 %	0 %	116326554
104	NC_008505	GAA	2	6	6839	6844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326554
105	NC_008505	ATT	2	6	6887	6892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326554
106	NC_008505	ATG	2	6	6937	6942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326554
107	NC_008505	CTGA	2	8	7017	7024	25 %	25 %	25 %	25 %	116326554
108	NC_008505	GAA	2	6	7029	7034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326554
109	NC_008505	AT	3	6	7112	7117	50 %	50 %	0 %	0 %	116326554
110	NC_008505	ACA	2	6	7181	7186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326554
111	NC_008505	TCA	2	6	7260	7265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326554
112	NC_008505	ATG	2	6	7333	7338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326554
113	NC_008505	TGT	2	6	7388	7393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326554
114	NC_008505	TCA	2	6	7553	7558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326554
115	NC_008505	AGA	2	6	7589	7594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326554
116	NC_008505	ATT	2	6	7674	7679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326554
117	NC_008505	AAC	2	6	7693	7698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326554
118	NC_008505	GGTT	2	8	7725	7732	0 %	50 %	50 %	0 %	116326554
119	NC_008505	ATG	2	6	7783	7788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326554
120	NC_008505	GAAGCA	2	12	7836	7847	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	116326554
121	NC_008505	TATTT	2	10	7916	7925	20 %	80 %	0 %	0 %	116326554
122	NC_008505	A	6	6	7986	7991	100 %	0 %	0 %	0 %	116326554
123	NC_008505	CAT	2	6	7998	8003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326554
124	NC_008505	GAA	2	6	8013	8018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326554
125	NC_008505	GTC	2	6	8141	8146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326554
126	NC_008505	A	6	6	8235	8240	100 %	0 %	0 %	0 %	116326554
127	NC_008505	A	6	6	8312	8317	100 %	0 %	0 %	0 %	116326554
128	NC_008505	T	6	6	8363	8368	0 %	100 %	0 %	0 %	116326554
129	NC_008505	ATTT	2	8	8371	8378	25 %	75 %	0 %	0 %	116326554
130	NC_008505	AT	3	6	8397	8402	50 %	50 %	0 %	0 %	116326554
131	NC_008505	A	6	6	8520	8525	100 %	0 %	0 %	0 %	116326554
132	NC_008505	AAT	2	6	8651	8656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326555
133	NC_008505	CTA	2	6	8674	8679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326555
134	NC_008505	ATTT	2	8	8693	8700	25 %	75 %	0 %	0 %	116326555
135	NC_008505	ATA	2	6	8777	8782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326555
136	NC_008505	ATC	2	6	8798	8803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326555
137	NC_008505	TGT	2	6	8838	8843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326555
138	NC_008505	CAT	2	6	8969	8974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326555
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140	NC_008505	GTT	2	6	9049	9054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326555
141	NC_008505	GTTTT	2	10	9119	9128	0 %	80 %	20 %	0 %	116326555
142	NC_008505	T	6	6	9125	9130	0 %	100 %	0 %	0 %	116326555
143	NC_008505	TA	3	6	9378	9383	50 %	50 %	0 %	0 %	116326556
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149	NC_008505	TAAT	2	8	9584	9591	50 %	50 %	0 %	0 %	116326556
150	NC_008505	AACA	2	8	9615	9622	75 %	0 %	0 %	25 %	116326556
151	NC_008505	TA	3	6	9675	9680	50 %	50 %	0 %	0 %	116326556
152	NC_008505	ATG	2	6	9747	9752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326556
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159	NC_008505	TAT	2	6	10565	10570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326557
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163	NC_008505	TAT	2	6	10683	10688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326557
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167	NC_008505	TTA	2	6	10793	10798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326557
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169	NC_008505	ACT	2	6	10849	10854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326557
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265	NC_008505	A	6	6	16245	16250	100 %	0 %	0 %	0 %	116326562
266	NC_008505	ACT	2	6	16287	16292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326562
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269	NC_008505	GAT	2	6	16436	16441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326562
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272	NC_008505	CTT	2	6	16539	16544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326562
273	NC_008505	CTT	2	6	16728	16733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326562
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369	NC_008505	CTTAT	2	10	22965	22974	20 %	60 %	0 %	20 %	116326566
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377	NC_008505	TG	3	6	23481	23486	0 %	50 %	50 %	0 %	116326566
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381	NC_008505	CTT	2	6	23723	23728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326566
382	NC_008505	TTCT	2	8	23785	23792	0 %	75 %	0 %	25 %	116326566
383	NC_008505	AAAC	2	8	23827	23834	75 %	0 %	0 %	25 %	116326566
384	NC_008505	AGAT	2	8	23850	23857	50 %	25 %	25 %	0 %	116326566
385	NC_008505	TGA	2	6	23995	24000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326566
386	NC_008505	TAT	2	6	24025	24030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326566
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389	NC_008505	CT	3	6	24080	24085	0 %	50 %	0 %	50 %	116326566
390	NC_008505	ATAG	2	8	24161	24168	50 %	25 %	25 %	0 %	116326566
391	NC_008505	ATT	2	6	24177	24182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326566
392	NC_008505	CTT	2	6	24190	24195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326566
393	NC_008505	T	6	6	24252	24257	0 %	100 %	0 %	0 %	116326566
394	NC_008505	TTC	2	6	24268	24273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326566
395	NC_008505	AAT	2	6	24314	24319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326566
396	NC_008505	T	6	6	24321	24326	0 %	100 %	0 %	0 %	116326566
397	NC_008505	T	6	6	24328	24333	0 %	100 %	0 %	0 %	116326566
398	NC_008505	ATC	2	6	24356	24361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326566
399	NC_008505	TAA	2	6	24417	24422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326566
400	NC_008505	TTCT	2	8	24496	24503	0 %	75 %	0 %	25 %	116326566
401	NC_008505	TTG	2	6	24514	24519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326566
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409	NC_008505	T	6	6	25512	25517	0 %	100 %	0 %	0 %	116326568
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453	NC_008505	AATTA	2	10	30647	30656	60 %	40 %	0 %	0 %	116326572
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